生物样本的标准化元数据可以释放收集的潜力

查尔斯大学理学院生态学系和捷克科学院脊椎动物生物学研究所的VojtěchBrlík呼吁科学家分享生物样本的基本信息(元数据)，以确保其在生物学科中的有效重新利用。

向科学界发出的呼吁发表在《自然》杂志上，它是基于协调AviSample网络元数据存储库所获得的经验，该存储库目前保存着近500个鸟类物种的35,000多个样本的元数据。

科学界一直在系统地优化研究活动，并且有许多举措积极追求这一目标。Brlík领导的项目进一步推动了这些努力，“我们的举措表明，样本基本信息(所谓的元数据)的可用性和可追溯性有潜力使科学研究更加高效、节省财务和人力资源并使研究团队多样化在全球层面上。”

他补充道：“这一举措并不涉及物理样本或数据的存储。我们只对生物样本的基本信息感兴趣，简单地说，样本是何时、何地、如何采集以及如何保存的。共享这些元数据价格低廉，适用于全球范围，并有助于使用已收集的样本，这对样本所有者和使用它们的研究人员都有好处。”

共享样本元数据和重新利用现有样本的原则在很多方面都是有益的。样本元数据的集中化和标准化报告使您可以轻松查看当前可用的样本，而无需与同事沟通或昂贵的新样本收集。

因此，共享元数据可以简化科学活动，特别是在难以进入的较少探索的领域，同时加强与当地科学家的重要合作。同样，报告样本元数据将有助于那些研究濒危物种或大空间尺度的科学家。

“这项计划的最初想法是在我的博士研究期间构思的，当时我正在寻找来自撒哈拉以南非洲大片地区的羽毛样本。我有来自我们研究小组的样本，但我需要扩展数据集相当。

“我们写信给瑞典和瑞士的同事，我们怀疑他们有来自非洲其他地方的类似样本。幸运的是，事实证明他们确实有这些样本。虽然他们主要出于完全不同的目的收集样本，但我们设法通过这项共同努力，覆盖了撒哈拉以南非洲地区的很大一部分，如果没有与同事的合作，这是不可能实现的。”Brlik在描述当前项目的起源时说道。

2022年，Brlík和同事团队(特别是查尔斯大学理学院生态系的PavelPipek和中科院脊椎动物研究所的PetrProcházka)创建了AviSampleNetwork元数据存储库。在这个数据库中，鸟类学家现在可以输入鸟类样本的元数据，即样本的采集地点、时间和方式、鸟类种类以及这些样本的存储方式。

该数据库目前包含近500种鸟类的信息，并提供超过35,000个样本的元数据。该存储库有许多大使，他们参与在各自地区传播该倡议。

“通过共享元数据实现现有样本重新利用的例子之一是B10K项目。该项目旨在调查所有10,000种鸟类的基因组，项目协调员主要从博物馆收集这些基因组。

“然而，对于稀有物种和发生在未研究地区(例如热带地区)的物种来说，获取样本并不容易。共享研究人员收藏中存储的样本元数据使得使用在非洲和欧洲收集的现有样本成为可能，-规模项目，”Brlik描述道。

Brlík在其文章中发表的一封信中以AviSample网络为例表示，共享元数据有助于重新利用研究人员收藏中存储的现有样本，因此具有巨大的潜力。

Brlík总结道：“我的目标是采取这一举措，在全球范围内改变人们的看法，并表明共享样本元数据有可能提高跨生物学科科学活动的效率。”