葡萄牙研究人员开发图像分析人工智能平台以促进全球研究

来自葡萄牙古尔本基安科学学院(IGC)的研究团队与芬兰ÅboAkademi大学、AI4Life联盟和其他合作者一起开发了一个名为DL4MicEverywhere的创新开源平台。这篇题为“DL4MicEverywhere：显微镜深度学习变得灵活、可共享和可重复”的论文发表在《自然方法》杂志上。

该平台为生命科学家提供了轻松使用先进人工智能(AI)来分析显微图像的方法。它使其他研究人员，无论其计算专业知识如何，都可以轻松地在自己的数据上训练和使用深度学习模型。

深度学习是人工智能的一个子领域，彻底改变了大型复杂显微镜数据集的分析，使科学家能够自动识别、跟踪和分析细胞和亚细胞结构。然而，由于缺乏计算资源和人工智能专业知识，一些生命科学研究人员无法在自己的工作中利用这些强大的技术。

DL4MicEverywhere为研究人员提供直观的界面，让他们能够在任何需要图像分析的实验以及从简单笔记本电脑到高性能集群的各种计算基础设施中使用深度学习模型，从而解决了这些挑战。

该研究的第一作者、IGC研究员IvanHidalgo-Cenamor表示：“我们的平台在人工智能技术进步和生物医学研究之间架起了一座桥梁。”

“有了它，无论研究人员在人工智能方面的专业知识如何，他们都可以获得尖端的显微镜方法，使他们能够自动分析结果并有可能发现新的生物学见解。”

DL4MicEverywhere平台建立在团队之前的工作ZeroCostDL4Mic的基础上，允许跨各种计算环境训练和使用模型。该平台还包括一个用户友好的界面，并扩展了用户可以应用于常见显微镜图像分析任务的可用方法的集合。

“DL4MicEverywhere旨在通过促进社区贡献和遵守科学研究软件的FAIR原则，实现显微镜人工智能的民主化，使资源可查找、可访问、可互操作和可重复使用，”该研究的联合负责人EstibalizGómez-de-Mariscal博士解释道。IGC研究员。

“我们希望这个平台将使世界各地的研究人员能够在他们的工作中利用这些强大的技术，无论他们的资源或专业知识如何。”

DL4MicEverywhere的开发是科学协作环境的一个很好的例子。首先，它的开发目的是让世界各地的研究人员能够利用最先进的显微镜技术，为加速科学发现做出贡献。其次，这只有通过计算机科学、图像分析和显微镜专家的国际合作才能实现，其中AI4Life联盟做出了重要贡献。

该项目由IGC的RicardoHenriques和奥博学术大学的GuillaumeJacquemet共同领导。

Jacquemet教授说：“这项工作代表着一个重要的里程碑，让人工智能更容易被显微镜界使用和重复使用。”“通过使研究人员能够轻松共享他们的模型和分析流程，我们可以加速发现并提高生物医学研究的可重复性。”

“DL4MicEverywhere有潜力为生命科学带来变革，”Henriques教授补充道。“它符合我们在AI4Life中的愿景，即开发可持续的人工智能解决方案，为研究人员提供支持并推动医疗保健及其他领域的创新。”

DL4MicEverywhere平台作为开源资源免费提供，反映了团队对开放科学和可重复性的承诺。研究人员相信，通过降低先进显微图像分析的障碍，DL4MicEverywhere将从基础细胞生物学到药物发现和个性化医疗等领域实现突破性发现。